El Laboratorio de Habilidades y Destrezas sustenta la filosofía de que los estudiantes tengan prácticamente desde el inicio de sus estudios y lo más a menudo posible contacto con las personas o comunidades usuarias de los Servicios de Salud. Es importante qua esas personas no sean tratadas por estudiantes sin ninguna experiencia. Por eso los estudiantes, reciben una preparación práctica en entrenamientos que son dados en forma sistemática por el Laboratorio de Habilidades el cual es el Centro de Habilidades Prácticas de la Facultad de Medicina tanto para Estudiantes de la Escuela de Tecnología Médica como de la Escuela de Medicina integrada en forma curricular en los Programas de Estudio de los estudiantes.
También pretende extender estas capacitaciones a Estudiantes de los Centros Regionales y de otras Facultades de la Universidad de El Salvador como a Personal de Salud en Servicio en el Ministerio de Salud del país y a otros docentes de Universidades Estatales Centroamericanas.

Otra de sus aspiraciones es que la Enseñanza por Asignaturas utilizada en   la Facultad, se transforme en un futuro no muy lejano y se emplee la Metodología de Aprendizaje Basado en Problemas.